Establecida el 4 de octubre de 1884, entre otros por Rafael Aguilar y Santillán que se convirtió en el alma de la Sociedad, se presume que se tiene 132,000 volúmenes, del total de la biblioteca, la otra parte de ésta se encuentra en custodia del Instituto de Investigaciones Históricas de la UNAM.

Fondo Sociedad Científica Alzate